شهد فرع الطب الباطني والوقائي في كلية الطب البيطري / جامعة بغداد مناقشة اطروحة الدكتوراه الموسومة (نسبة انتشار الجراثيم المعوية في الإبل في محافظة النجف الأشرف مع الكشف الجزيئي للجراثيم الاكثر انتشارا) للطالب علي كاظم حمزة.
هدفت هذه الدراسة لعزل وتحديد مسببات الأمراض المعوية في الإبل وتحديد نمط الحساسية للمضادات الميكروبية للأنواع المعزولة والكشف عن البكتيريا الأكثر انتشارًا والممرضة عن طريق تفاعل تسلسل البلمرة وشجرة النشوء والتطور. تضمنت هذه الدراسة 250 جملاً بأعمار 1-3 سنوات من كلا الجنسين 186 ذكراً و 64 أنثى في الفترة من يناير 2022 إلى ديسمبر 2022، 150 جملاً في مجزرة محافظة النجف الأشرف و 100 جملاً في الحقل من ثلاث محافظات (النجف وكربلاء والمثنى). خضعت جميع الحيوانات الى الفحص السريري العام الذي يتضمن وجود التفاعلات الجهازية, وجود اوعدم وجود إسهال وجفاف. وتم جمع 600 عينة في المجزره: 150 عينة براز تم جمعها قبل ذبح الإبل و 450 عينة (150 لكل من محتوى العقدة الليمفاوية المساريقية والكبد وغشاء الأمعاء الدقيقة) تم جمعها بعد ذبح الحيوان. وتم جمع 100 عينة براز (36، 41، 23) من الإبل الموجودة في محافظات كربلاء والنجف والمثنى على التوالي. اعتمدت الدراسة التشخيصية على الخصائص المظهرية والزرعية للعزلات بعد زراعتها على ماء الببتون، ثم وسط ماكونكي، ووسط المغذي وعلى بعض الأوساط الانتقائية مثل وسط الكروم الخاص ب E.coli O157:H7 ,Deoxycholate (XLD) Xylose Lysine Deoxycholat، باستخدام الاختبارات البيوكيميائية المختلفة واختبار فيتيك واختبار الحساسية للمضادات الحيوية. أظهرت النتائج عزل 117 عزلة من بكتيريا E. coli، و4 عزلات فقط هي E.coli O157:H7، بلغ العدد الكلي للعزلات 128 عزلة ما عدا (113 عزلة E. coli) غير مصنفة و65 Proteus spp. 65 (50.7%)؛ تليها كليبسيلا. 45 (35.1%)؛ السالمونيلا 12 (9.37%) والإشريكية القولونية O157:H7 E.coli 4(3.12%)؛ وأخيرا Serretia spp. 2 (1.56%). من اهم العلامات السريرية والتي ظهرت على الإبل المصابة بالسالمونيلا والإشريكية القولونية O157:H7 هي التفاعلات الجهازية المرتفعه، وظهور إسهال شديد مع الإشريكية القولونية O157:H7 و2 من الإبل أظهرت إسهال دموي ,وفي الحيوانات المصابة بالسالمونيلا أظهر براز أخضر اللون مع جفاف شديد و جمل واحد مصاب بالإسهال الدموي ,الإبل التي يقل عمرها عن سنة تعتبر الأكثر إصابة، وتزداد الإصابة في إناث الإبل أكثر من الذكور. من ناحية أخرى اظهرت المضادات الحيوية ضد الايشيريكية القولونية O157 مقاومة عالية متعددة بنسبة 100% للأمبيسيلين، أموكسيسيلين، إريثرومايسين، سلفاميثوكسازول، تريميثوبريم، كلورامفينيكول وحمض الناليديكسيك، وحساسة بنسبة 100% للسيبروفلوكساسين والأميكاسين، بينما السالمونيلا أظهرت مقاومة متعددة بنسبة 100% للسيبروفلوكساسين والأميكاسين. مقاومة الجنتاميسين، الاريثروميسين، التتراسيكلين، سيبروفلوكساسين، أميكاسين، سلفاميثوكسازول، تريميثوبريم، حمض الناليديكسيك والسيفوتاكسيم. لكن البكتيريا الأخرى Proteus أظهرت مقاومة للأمبيسيلين والأموكسيسيلين والتريميثوبريم بينما أظهرت البكتيريا Klebsiella spp. أظهر مقاومة للأمبيسلين فقط. أظهرت عزلتا Serriatia oderfera التي تم فحصها باختبار Vitic مقاومة لمضادي Ticarcillin و Piperacillin. أظهرت نتيجة PCR أن الحمض النووي لأربعة معزولين من O157:H7 يمتلكون الجينات الأربعة (Stx1 وStx2 وFliC وRfbE). وتم تحليل نتيجة تحليل التسلسل عن طريق برنامج اداة المحاذاة المحلية في المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) عبر الإنترنت و برنامج BioEdit للكشف عن شجرة النشوء والتطور في Salmonella enterica subsp. بعد محاذاة تضخيم المنتج لـ Salmonella spp. الجينinvA في الجمل، معرف التسلسل: LC730847 و LC730849 ممثلين بـ S.enteriditis، تم جمع السلالتين العراقيتين المحليتين LC730846 و LC730850 ممثلين بـ S. typhimurium
أستنتجت هذه الدراسة أنه تم اكتشاف عزلة عراقية واحدة من السالمونيلا بونا(S. pona) برقم الانضمام (LC730848). أظهرت الايشيريكيا القولونية H7 :O157المسجلة في ((NCBIالمعزولة من مصدر مختلف تحت شجرة النشوء والتطور لـ E.coli O157H7 لـ RfbE أن العزلات الأربع التي لوحظت في الدراسة الحالية متجمعة في فرع واحد: Clade 1 (CP103864.1 وCP038496) .1) بنسبة 79% تشابه بين العزلات، و 81% تشابه مع الصنف 2 الآخر الذي يشمل جميع عزلات تسلسلنا (LC74356.1، LC743562.1، LC743563.1 و LC743564.1) بنسبة تشابه 100% بينهما.
